卡尔玛·扎比战死5天后，吉恩军的亚洲攻略作战遭到了联邦军激烈的抵抗，只得开始撤退。撤退中与主力部队失去联系的第17MS小队“狼牙队”在戈壁沙漠的中心发现了联邦军的秘密基地。在基地里那个“白色恶魔”的新型机正在进行战斗实验。尽管孤立无援，但狼牙队队长亨利还是决定强攻基地。
献给赴死者的祈祷是1995年2月万代发售的SFC游戏《机动战士高达 CROSS DIMENSION 0079》最后6关的原创故事，也是之后由万代主导的高达外传游戏的开端之作，人设和机设分别由川元利浩和大河原邦男负责。原本游戏的设计师神谷春辉就是想制作一部完全原创剧情的高达游戏，但因为万代方面想顾及更多没有看过高达原作的玩家，所以添加了原作剧情作为游戏的前半段14关，受制于当时卡带容量的关系最后原创剧情只能压缩到了6关。（具体可参考制作人访谈栏目）2014年5月PS3发售的《机动战士高达SIDE STORIES MISSING LINK》中本作以3D形式进行了重制。
献给赴死者的祈祷是1995年2月万代发售的SFC游戏《机动战士高达 CROSS DIMENSION 0079》最后6关的原创故事，也是之后由万代主导的高达外传游戏的开端之作，人设和机设分别由川元利浩和大河原邦男负责。原本游戏的设计师神谷春辉就是想制作一部完全原创剧情的高达游戏，但因为万代方面想顾及更多没有看过高达原作的玩家，所以添加了原作剧情作为游戏的前半段14关，受制于当时卡带容量的关系最后原创剧情只能压缩到了6关。（具体可参考制作人访谈栏目）2014年5月PS3发售的《机动战士高达SIDE STORIES MISSING LINK》中本作以3D形式进行了重制。
大地上，那些曾经喷射出火焰的战士一动不动的躺着，再也无法站起，请给那些赴死者祈祷吧！
时间倒转回去，那是在卡尔玛·扎比战死不久，宇宙世纪0079年10月9日，在灼热的戈壁沙漠中……
戈壁沙漠的中心，每日都在进行战斗测试的博克上尉面前，突然出现了使用特制武器的吉恩军MS部队。在诺克特少校的指挥下，博克上尉与战友们驾驶钢加农出击迎敌。但是敌人MS的战斗力远远高于他们的预想，4台钢加农被击毁，仅剩下最后2台苦苦支撑。这样下去整个基地将会全灭，意识到危机的博克上尉请求诺克特少校批准使用实验中的新型高达。
“哼！……知道了，想用就用吧。不过在那之前你该先求我让你这个废物使用精灵，然后跪下来用舌头舔我的鞋底！”
忍受着少校侮辱的博克上尉依然决定驾驶精灵出击，在他身后支援的仅有达巴·索中士和萨纳·尼玛下士驾驶的钢加农。
“先对付扎古！扎古！”
之前的战斗中已经领教过对方新型蓝色MS惊异战斗力的博克向部下下达了指示。
敌人的MS对于格斗战异常自信，来回突进，还没习惯操纵精灵的博克能击败他吗？
热砂的战场上又将展开激烈的死斗，谁生谁死，现在还没人知道……
时间倒转回去，那是在卡尔玛·扎比战死不久，宇宙世纪0079年10月9日，在灼热的戈壁沙漠中……
戈壁沙漠的中心，每日都在进行战斗测试的博克上尉面前，突然出现了使用特制武器的吉恩军MS部队。在诺克特少校的指挥下，博克上尉与战友们驾驶钢加农出击迎敌。但是敌人MS的战斗力远远高于他们的预想，4台钢加农被击毁，仅剩下最后2台苦苦支撑。这样下去整个基地将会全灭，意识到危机的博克上尉请求诺克特少校批准使用实验中的新型高达。
“哼！……知道了，想用就用吧。不过在那之前你该先求我让你这个废物使用精灵，然后跪下来用舌头舔我的鞋底！”
忍受着少校侮辱的博克上尉依然决定驾驶精灵出击，在他身后支援的仅有达巴·索中士和萨纳·尼玛下士驾驶的钢加农。
“先对付扎古！扎古！”
之前的战斗中已经领教过对方新型蓝色MS惊异战斗力的博克向部下下达了指示。
敌人的MS对于格斗战异常自信，来回突进，还没习惯操纵精灵的博克能击败他吗？
热砂的战场上又将展开激烈的死斗，谁生谁死，现在还没人知道……
不要说植物，连小动物身影都看不见的戈壁沙漠，在这片不毛之地上有一些与大部队走散的散兵游勇。
如今在他们面前的是地球联邦军的秘密基地，对于没有武器、弹药、食物补给的他们来说这个基地就如同绿洲一般。但是那里却有着白色的死神……
经过第一次进攻后短暂休整的狼牙队依然监视着基地，这时另一支与主力部队走散的吉恩MS部队也发现了基地，但基地里突然出现的高达却将他们消灭殆尽，这样可不能贸然进攻。
瑞斯塔下士主张放弃进攻基地，想办法先与主力部队汇合，但马丁上士却不同意他的说法。
“在这种一望无际的沙漠里怎么能找到大部队？在找到他们之前我们就变成干尸了。另外那家伙应该还没习惯操纵那台MS，虽然他是个不错的机师，但他还没法发挥出那台机体全部的性能。现在就是好机会！等那家伙习惯操纵后我们就真没机会了！”
“马丁说的很对，现在我们应该采用游击战！Hit and Away 一击脱离！”
队长亨利上尉下定了决心，他们的作战能成功吗？
边境的戈壁沙漠，为了击败精灵高达，亨利上尉率领的狼牙队不断发动攻击。但是面对新型高达的强大性能，他们的进攻不断被击退。几度在战场出生入死的强者从未遭遇过如此棘手的对手，战斗中他还失去了雷和瑞斯塔两名部下。
博克上尉与战友们阻挡住了吉恩MS的轮番冲击，但等待他们的却是诺克特少校放弃基地的命令。
“上尉，6小时后我们要放弃这个基地。”
“放弃？你要舍弃这个基地吗？”
博克质疑道。
“你这家伙，难道要质疑我的判断吗？达巴、萨纳！你们两个负责护卫我。上尉，你在我的米迪亚出发时负责去引开敌人！”
博克登上精灵，独自前去迎击再次袭来的敌人。
朝阳照亮的沙丘上站着三台MS，狼牙队最后的攻击即将展开。
“萨奇，听说之前你的志愿是加入兰巴·拉尔上尉的部队吧？结果却碰到像我这样差劲的队长，你的运气也真够差的。”
博克上尉与战友们阻挡住了吉恩MS的轮番冲击，但等待他们的却是诺克特少校放弃基地的命令。
“上尉，6小时后我们要放弃这个基地。”
“放弃？你要舍弃这个基地吗？”
博克质疑道。
“你这家伙，难道要质疑我的判断吗？达巴、萨纳！你们两个负责护卫我。上尉，你在我的米迪亚出发时负责去引开敌人！”
博克登上精灵，独自前去迎击再次袭来的敌人。
朝阳照亮的沙丘上站着三台MS，狼牙队最后的攻击即将展开。
“萨奇，听说之前你的志愿是加入兰巴·拉尔上尉的部队吧？结果却碰到像我这样差劲的队长，你的运气也真够差的。”
即将奔赴最后战场的亨利上尉突然对萨奇说道。
“没有这回事，上尉和拉尔上尉一样了不起，都是军人的楷模。”
“……你应该知道的吧？”
听到萨奇的回答，亨利冷不丁说了一句。
“是指上尉执着于那台新型机的理由吗？”
对于亨利来说战争的输赢都已经无所谓了，在这场无聊的战争中他终于有了一个目标，那就是打败那台新型机。
10天前亨利就接到了破坏联邦军新型MS的特命，但他却一直对部下守口如瓶。
“我无法原谅使用毒气杀害平民的扎比家，我是军人，不管是杀人还是战死，都要用堂堂正正的战斗来决定……”
“别扯这些有的没的了，只要决出谁最强不就可以了。是吧，萨奇？”
马丁中士帮他们做了总结发言。
3台MS背着朝阳从沙丘上疾驰而下……最后的决战终于开始了。
“没有这回事，上尉和拉尔上尉一样了不起，都是军人的楷模。”
“……你应该知道的吧？”
听到萨奇的回答，亨利冷不丁说了一句。
“是指上尉执着于那台新型机的理由吗？”
对于亨利来说战争的输赢都已经无所谓了，在这场无聊的战争中他终于有了一个目标，那就是打败那台新型机。
10天前亨利就接到了破坏联邦军新型MS的特命，但他却一直对部下守口如瓶。
“我无法原谅使用毒气杀害平民的扎比家，我是军人，不管是杀人还是战死，都要用堂堂正正的战斗来决定……”
“别扯这些有的没的了，只要决出谁最强不就可以了。是吧，萨奇？”
马丁中士帮他们做了总结发言。
3台MS背着朝阳从沙丘上疾驰而下……最后的决战终于开始了。
激战还在继续，唯有诺克特少校乘坐米迪亚逃离了基地。
破坏殆尽的基地里最后只剩下化为战神的精灵与伊芙利特，2台MS在如同地狱业火般燃烧的爆炎中激战……
“去地狱向我死去的部下谢罪吧！”
“切！还没完呢！在杀了诺克特那个混蛋前我是不会死的！”
两人的嘶喊声飘荡在战场上……
破坏殆尽的基地里最后只剩下化为战神的精灵与伊芙利特，2台MS在如同地狱业火般燃烧的爆炎中激战……
“去地狱向我死去的部下谢罪吧！”
“切！还没完呢！在杀了诺克特那个混蛋前我是不会死的！”
两人的嘶喊声飘荡在战场上……
SFC版故事是以联邦军的视角展开，最后结局是打败伊芙利特的博克在戈壁中发现了狼牙队唯一幸存的萨奇，两人一起离开了战场，最后字幕还写了个意味深长的 To Be Continued，原本按照神谷春辉的设想他们之后还会有新的故事……
PS3重制版是以吉恩军的视角展开，最后的战斗里萨奇在诺克特少校乘坐的米迪亚起飞前追上了飞机并引爆了身上的炸弹，与诺克特同归于尽，博克生死不明，最后荒漠中的精灵高达被联邦军回收，算是给神谷春辉原本烂尾的故事划了个句号。
PS3重制版是以吉恩军的视角展开，最后的战斗里萨奇在诺克特少校乘坐的米迪亚起飞前追上了飞机并引爆了身上的炸弹，与诺克特同归于尽，博克生死不明，最后荒漠中的精灵高达被联邦军回收，算是给神谷春辉原本烂尾的故事划了个句号。